ממשלת ניקרגואה הודיעה ביום רביעי (ה-2 ביוני) על ניתוק את הקשרים הדיפלומטיים עם ישראל, בעקבות ההרג בלב ים של פעילי המשט לשבירת המצור על עזה. רוסאריו מוריליו, רעייתו של נשיא ניקרגואה דניאל אורטגה, המשמשת גם כדוברת הממשלה במנגואה, מסרה בהודעה קצרה כי “ניקרגואה החליטה להשעות מהיום את יחסיה הדיפלומטיים עם ישראל”. בהודעה נכתב עוד כי “ממשלת ניקרגואה סבורה שההשתלטות על ספינות המשט מהווה התקפה בלתי חוקית והפרה בוטה של החוק הבינלאומי”.

ממשלת ניקרגואה הביעה גם תמיכה בלתי מסוייגת בעם הפלסטיני וקראה להפסקה מיידית של המצור על הרצועה. הדברים מצטרפים להחלטה שהתקבלה ביום שלישי בבוקר באו”ם, לפיה מועצת הביטחון מגנה את ישראל על פעולותיה נגד המשט, שהביאו למותם של תשעה אזרחים. בהמשך להחלטה קראה מועצת הביטחון לקיים חקירה “מיידית, בלתי תלויה, אמינה ושקופה”, של האירועים.

נשיא אקואדור, רפאל קוראה, הודיע ביום חמישי (ה-3 ביוני) כי השיב את שגריר המדינה בישראל להתייעצויות בקיטו, בעקבות פעולות ישראל נגד משתתפי משט השלום לרצועת עזה. בהודעה שפרסם משרד החוץ בקיטו נמסר כי השגריר יעזוב את תל אביב מיד, “בצעד מחאה נגד ההתקפה שבה נהרגו ונפצעו אזרחים”.